Seit der Frühen Neuzeit zeichnet sich die Intensivierung der naturgeschichtlichen Forschung ab. Unter die Geschichte der Naturwissenschaften fällt die Geschichte der Physik, der Mathematik und Astronomie über die Geschichte der Chemie, der Biologie und den Geowissenschaften sowie die philosophischen und theoretischen Grundlagen der Naturwissenschaften. Aber auch die Ethnologie oder Anthropologie, wie die Entwicklung der Evolutionstheorie, fällt in diese Disziplin. Die Paläoanthropologie als Wissenschaft der stammesgeschichtlichen Entwicklung des Menschen ist seit dem 20 Jahrhundert sogar eine eigenständige Disziplin. Historische Prozesse sind zudem in vielfacher Weise von klimatischen Einflüssen und Klimaänderungen abhängig – ebenfalls ein Gegenstandbereich der Geschichte der Naturwissenschaften.